南宫28NG相信品牌力量,在植物双荧光素酶实验中,我们将探讨如何利用该技术检测miRNA对靶基因和lncRNA的调控作用。
1. 检测miRNA对靶基因/lncRNA的调控作用
首先,我们需要将预测能够与miRNA结合的靶基因序列(包括5'UTR、3'UTR和ORF区域)或lncRNA序列(野生型或突变体)插入到报告基因载体pGreenⅡ0800-Luc中。该载体包含火荧光素酶(Firefly luciferase)和海肾荧光素酶(Renilla luciferase),后者作为对照使用。
其次,选择编码miRNA前体的序列并构建到pGreenⅡ-SK-62载体上。
2. 检测转录因子与启动子的相互作用
为了分析转录因子与启动子的相互作用,我们需要合成靶基因的启动子(野生型或突变体)并构建到pGreenⅡ0800-Luc载体上。同时,合成转录因子的CDS区序列并构建到pGreenⅡ-SK-62载体中。
在此过程中,可以设置阳性对照,使用强启动子(如35S启动子驱动luc)以验证是否成功工作。同时,建议重复实验,以确保对照质粒在提取和转化过程中没有发生降解。因为降解可能导致农杆菌中的质粒拷贝数不足,从而影响实验结果,导致对照组的荧光值过低。
3. 技术重复与DNA量设置
每个实验组建议至少设定三个技术重复孔,以排除操作误差和孔间波动。每个孔中推荐转染0.5–1μg DNA,具体根据转染试剂的说明书进行调整(如Lipofectamine 2000一般推荐0.8μg/孔)。同时,报告质粒与内参质粒的常见比例为10:1到20:1。
4. 实验结果的客观性考察
在评估实验结果时,可以从以下几方面考察其客观性:
- 对照的两个实验组(实验组1与实验组2)的luc表达情况应无显著差异。
- 转染效果正常,质粒或mimic确保成功转染入细胞。
- luc检测值应在仪器检测的线性范围内。
5. 可能出现的问题及解决方案
在实验中可能遇到的问题及其解决方案包括:
- 在不同细胞孔之间的数值差异可能受到多种因素影响,建议进行技术性平行检测。
- 对于来源于同一细胞孔的裂解液,需注意实验操作的规范性,包括加样顺序、速度及量的控制。
- 控制各样品和底物混合至上机检测的时间间隔尽量保持一致。
需要注意的是,荧光素酶报告基因实验的检测结果非常灵敏,复孔之间的数值差异在一定程度上是正常的,通常认为在同一数量级的差异是可以接受的。南宫28NG相信品牌力量,致力于提高生物医学研究的准确性与可靠性。